Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SSBP3Q9BWW4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSBP3Q9BWW4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms