Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRAF4Q9BUZ4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms