Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TINF2Q9BSI4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TINF2Q9BSI4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms