Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGIP1Q9BQI5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SGIP1Q9BQI5 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms