Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PMCHL2Q9BQD1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PMCHL2Q9BQD1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms