Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MEIS3Q99687 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MEIS3Q99687 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms