Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DCLRE1CQ96SD1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DCLRE1CQ96SD1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms