Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PCNX1Q96RV3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PCNX1Q96RV3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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