Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PGBD1Q96JS3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PGBD1Q96JS3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms