Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
LRIG1Q96JA1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LRIG1Q96JA1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms