Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZBED3Q96IU2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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