Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCDC97Q96F63 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms