Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM4SF18Q96CE8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms