Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPTSSAQ969W0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms