Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RNF34Q969K3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms