Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERCC4Q92889 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERCC4Q92889 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERCC4Q92889 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERCC4Q92889 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERCC4Q92889 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERCC4Q92889 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERCC4Q92889 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERCC4Q92889 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERCC4Q92889 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERCC4Q92889 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ERCC4Q92889 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms