Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATRIPQ8WXE1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms