Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIPC3Q8TF64 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms