Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IGSF1Q8N6C5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGSF1Q8N6C5 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms