Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
P3H3Q8IVL6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
P3H3Q8IVL6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms