Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG4DQ86TL0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms