Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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TRAPPC6BQ86SZ2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TRAPPC6BQ86SZ2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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