Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SETXQ7Z333 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SETXQ7Z333 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms