Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HECW1Q76N89 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms