Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
C9orf47Q6ZRZ4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms