Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRIM72Q6ZMU5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM72Q6ZMU5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms