Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMARCD3Q6STE5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms