Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZBED9Q6R2W3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZBED9Q6R2W3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
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