Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NANOGP8Q6NSW7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms