Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
AGAP9Q5VTM2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms