Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CCDC38Q502W7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CCDC38Q502W7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms