Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDKN3Q16667 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms