Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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NRF1Q16656 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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NRF1Q16656 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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NRF1Q16656 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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NRF1Q16656 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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NRF1Q16656 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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NRF1Q16656 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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NRF1Q16656 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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NRF1Q16656 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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NRF1Q16656 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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NRF1Q16656 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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NRF1Q16656 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NRF1Q16656 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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