Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GRIK4Q16099 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GRIK4Q16099 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms