Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP6AP1Q15904 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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