Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ALX1Q15699 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ALX1Q15699 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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