Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PUM3Q15397 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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