Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTPAQ15257 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms