Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC10A1Q14973 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC10A1Q14973 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms