Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SQLEQ14534 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SQLEQ14534 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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