Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRIM25Q14258 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TRIM25Q14258 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms