Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARB2Q14108 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms