Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PKP1Q13835 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PKP1Q13835 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms