Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNASE1L3Q13609 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNASE1L3Q13609 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNASE1L3Q13609 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNASE1L3Q13609 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms