Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PICALMQ13492 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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