Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMAD4Q13485 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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