Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCGQ13326 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SGCGQ13326 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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