Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DUSP4Q13115 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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