Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
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