Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
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TRIM32Q13049 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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TRIM32Q13049 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRIM32Q13049 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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TRIM32Q13049 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRIM32Q13049 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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